推古天皇３０(６２２）年、太子は自らの死に臨み、長子の山背大兄皇子に遺言してこの地に寺を創建するように命じたと伝わっています。（法起寺塔露盤銘）（聖徳太子伝私記）
この地はかつての岡本宮（現在の法起寺付近）跡でした。
また法華経を講讃された（推古天皇十四年：６０６）地であり、太子建立七寺の一つです。
『法華経義疏』は聖徳太子による妙法蓮華経の注釈書の草本とされています。
残念なことに太子自らが記したものかどうかの記録は残っていませんが、和風漢文や六朝風書体などから飛鳥時代に我が国で記されたものにはちがいないとされています。
『日本霊異記』の記述によると太子居住の足跡がみられますが、太子妃：刀自古郎女（山背大兄皇子の生母）の居住地だとする見方もあります。
法起寺には下層遺構が存在していることが発掘調査で確認されており、この下層遺構は北で西方向に２０度前後振れています。
これは斑鳩宮や若草伽藍の遺構とも一致しており、尚かつ飛鳥時代の遺物も出土しているために、岡本宮に関連する遺構として有力視されています。
舒明天皇１０（６３８）年に福亮僧正が、太子のために金堂と弥勒像を造立し
天武天皇１５（６８５）年に恵施僧正が宝塔の建立を発願し、慶雲３（７０６）年に塔の露盤が造られたと伝えられています。
別名を岡本寺・岡本尼寺とも呼ばれ池尻寺・池尻尼寺とも称されています。
高さ２４ｍの白鳳の三重塔（国宝）は日本最古の三重塔として有名です
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